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大数据团队找到了“新冠”的新“识别码”
发布时间:2020/03/31 新闻 浏览:469
由一群专家学者临时起意成立的一支研究团队,在三个星期的时间里,通过大数据分析研究,在全球范围内首次发现了新冠肺炎的显著特征!这项工作的发起人――上海柯林布瑞公司的联合创始人、长宁区知新荟会员秦晓宏,与一群志同道合的专家夜以继日进行研究分析,成功找到新冠肺炎与非新冠毒性肺炎的鉴别指标,共同为上海乃至全国新冠肺炎防控提供了帮助。
一支群里“挂牌成立”的研究团队
疫情来势凶猛,新冠病毒检测与鉴别是医护人员面临的主要难题之一,很多病例在确诊前都出现过假阴性的情况。秦晓宏介绍,新冠肺炎的确诊方式普遍采用CT影像学检测和病毒核酸检测,然而以上两种检测手段都有着明显的局限性:如果严格按照核酸检测结果阳性判断,因核酸检测阳性率低,存在大量的假阴性,延误治疗,而且咽拭子取样过程对于医护人员而言增加了暴露风险;如果放宽标准,用CT阳性诊断可能又会提高假阳性率,因为各类病毒性肺炎在CT影像上的表现并无显著差异。
“患者是新型冠状病毒感染者,但是检测报告却呈现阴性,不少病人要经过三四次检测,才能最终被确诊新冠病毒阳性。这不但令医护人员在采集、测试的过程中增大暴露风险,而且也大大耽误了病人的治疗进程,最终造成我们不愿看到的结果。”这些救治过程中对病人的治疗和对医生的危险让秦晓宏感到着急和痛心。”
疫情发生后,秦晓宏身边的知新荟朋友们纷纷捐款捐物、建言献策,他说:“我是医疗行业从业人员,也要给知新荟、长宁区争光!”秦晓宏所在的柯林布瑞是一家国内领先的医疗大数据企业,于是,他下定决心发挥企业专长,打算通过大数据技术的手段,帮助临床一线的医生找到更好、更准确的方法识别新冠肺炎。
2月3日,秦晓宏在公司的客户微信群里发起了号召,表达了希望组建工作组、找出新冠肺炎的鉴别新方法的想法。很快,他就收到了全国多个医院专家们的肯定答复。于是,一支“大数据、战疫情”紧急研究团队就这样在微信群里“挂牌成立”了。来自天南地北的专家们和柯林布瑞的大数据团队投入了紧张的分析研究过程中。
全球首次发现新冠肺炎的临床鉴别指标
作为研究发起人,秦晓宏联合柯林布瑞公司大数据团队、海军军医大学长海医院、佛山市第一人民医院、温州医科大学温州医学院附属第二医院的多位教授、医生,共同组成了“大数据、战疫情”紧急研究团队,快速确定了以鉴别新冠肺炎与非新冠毒性肺炎为研究方向。尽管这样一支专业的团队有着非常先进的大数据分析系统,但所有人时刻绷紧神经,生怕出现任何疏漏。
“流行病学数据、诊断数据、检验数据、影像报告数据、生命体征数据、电子病历数据……要对比分析的数据实在太多。”回忆起当时的工作状态,秦晓宏说,“想着研究成果能够真正帮助到前线疫情防控,大家都像打了鸡血一样!”研究团队通过对75例新冠肺炎普通型患者与以往90例非新冠病毒性肺炎患者的临床数据进行脱敏处理,把众多复杂的数据进行清洗整合,对临床数据的术语进行统一化处理,对缺失值、低样本量、离异值的数据进行剔除,通过曼-惠特尼U检验等方法,又在柯林布瑞基于大数据的新冠肺炎与非新冠病毒性肺炎对照研究平台上,对照研究两者在临床表现、实验室检验结果、肺部影像学、合并基础疾病、药物治疗及临床转归等方面的差异,进行反复研究。
功夫不负有心人,经过三个星期加班加点的研究工作,工作组在全球范围内首次发现了新冠肺炎与非新冠病毒性肺炎在临床检验结果上有显著性差异的特征数据――粒淋比(NLR)即中性粒细胞与淋巴细胞绝对值的比值!新冠肺炎患者该指标的平均值较其它非新冠病毒性肺炎患者整体显著偏小。通过观察对比两类患者的粒淋比(NLR)指标可以发现,新冠肺炎患者该指标的平均值较非新冠肺炎患者小42%,中位数较非新冠肺炎患者小64%,最大值仅为非新冠肺炎患者的44%,整体显著偏小且更为集中。
更多分析工作依然在紧张进行
“这项研究成果可以帮助临床医生用更快速、更常规的方法实现新冠肺炎与非新冠病毒性肺炎的精准鉴别诊断,第一时间给新冠肺炎确诊。”研究成果让秦晓宏十分激动。其实,研究团队在对比了将近30多个样本数据时,已经初步判断出‘粒淋比’就是想找的答案。“但当时,考虑样本数量较小,不足以完全支撑我们的结论,加上这项工作兹事体大,不能出现丝毫纰漏,所以我们又加大了样本量进行进一步确认。”秦晓宏说。
除了对临床检验数据对照研究外,目前,这支研究团队还在继续开展很多分析工作。对发热、干咳、腹泻等各类临床症状进行对照分析;对患者是否高血压、糖尿病、心脏病等合并的基础疾病进行分析,并进一步研究对于新冠肺炎与非新冠病毒性肺炎,两者的基础疾病分别与预后的关系;对新冠肺炎与非新冠病毒性肺炎患者的发病时间、收住时间、转ICU时间、出院时间等各时间节点进行对照分析,研究两者的疾病演变差异……众多的工作依然在进行着。
“虽然我们不是站在抗击疫情最前线的战壕里,但是我们也要用自己的行动,为医护人员铸造出一把可靠的‘利剑’!”秦晓宏表示,近期,研究团队将在医学杂志上发表详细的研究成果。